El Bàltic acull sota les seves aigües una gran diversitat de fauna, igual que a les illes i en les dispars costes dels països que el circumden. El litoral que s'estén des d'Estònia fins a Finlàndia comprèn desenes de milers d'illes, l'illa sueca de Gotland i la mar de l'arxipèlag finlandès. A l'illa pedregosa i plana de Saaremaa és present el uapití i la foca grisa, i en la de Gotland, l'àguila real. Aquesta illa sueca té colònies de xatrac gros i una ciutat medieval patrimoni de la humanitat: Visby.
